Стрелок возвращается из Зоны с военными (оконцовка Зова Припяти) и опять оказался на Кордоне. Новые и старые персы, новые группировки и новейшие приключения Стрелка в Зоне полного отчуждения.

Игра С.T.A.Л.K.E.Р.- "Апокалипсис" - Наследство Коллекционера/S.T.A.L.K.E.R. - "Apocalypse"- Inheritance of Collector начинается с того момента где закончилась предыдущая версия игры Зов Припяти.

После трагического события, имея на плечах восьмилетнего сына и молодую ассистентку Элизабет, Доктор Апокалипсис (как его прозвали коллеги) скрылся от всего мира в построенном им бункере.